蛋白質的MD模擬在超算上和GPU上跑,效率有多大差別呢?

時間 2021-05-31 10:01:11

1樓:破風

GPU作用是協同處理,CPU是主處理器,協調處理器和主處理器缺少一樣都會大大降低效能,打個比方,CPU就像大學生,可以同時算加減乘除,協處理器像是小學生,只能在同一時間進行單一操作,比只能算加或者乘。大學生(CPU) 可以通過分配的方法,把乙個問題中涉及的大量加減乘除拆開分配給小學生(GPU或者協處理器),大學生(CPU)只需要利用小學生(GPU或者協處理器)得出的結果來解題即可。大大減少了大學生(CPU)的工作量,提高了解決問題的速度。

所以協處理器和GPU的存在是加速CPU的運算過程,而主要進行運算的還是CPU。

2樓:lammer ren

配置介紹

天河一號

6144個通用處理器(3072x2 Intel Quad Core Xeon E5540 2.53GHz/E5540 3.0GHz);

–5120個加速處理器(2560 ATI Radeon 4870x2 575MHz)

–記憶體總容量98TB ;

–點點通訊頻寬40Gbps ;

–共享磁碟總容量為1PB

天河一號A

2048顆中國仿製sun公司的UltraSparc T2處理器(飛騰FT-1000)八核心處理器

–14336顆Intel Xeon X5670 2.93GHz六核心處理器

–7168塊NVIDIA Tesla M2050高效能計算卡

CPU的運算能力一直在提高,只不過GPU運算能力依然遠大於CPU。

在超算中,CPU主要起控制作用,GPU才是運算的主力。

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