1樓：
題主你說得對。
穿過透明玻璃的光子的確有可能在玻璃裡被湮滅並產生新的不一樣的光子（波長）(拉曼散射，四波混頻，等等），也有可能會有相位改變(自相位調製，交叉相位調製)，更有可能偏振態發生改變(雙折射率結構），這時射出的光子可以被認為是不同的光子。
這都在非線性光學考慮的範圍，但是由於可能性極低，所以線性量子光學分析中不做考慮，並且現在的測量手段一般並不能測量因為非線性光學而產生的偏差。實際上這個領域也有自己的學科，參見single photon phase shifter和single photon optical kerr effect等等。
2樓：
光穿過玻璃、空氣等介質當然有吸收了！
單光子在傳輸時的損耗是量子資訊研究裡的乙個大問題。由於每個光子都帶一位元的資訊，損失乙個光子相當於把整個01串做了一位平移。
為了減少資訊傳輸時的失真，學者們在最簡單的原理性的光路上又加了乙個個輔助器件。最後的結果相當於從中學電路到大學模擬（數字）電路的轉變。
更深入的我也說不出來，當初就是看到許多諸如此類實用中不得不考慮的問題，我下定決心遠離這個工科專業。
3樓：麥克斯偉
樓主高中物理時應該學過拿He碰撞金箔的實驗吧？那個時候你的老師應該有跟你講，由於原子核周圍很大一部分的作用力很弱，所以絕大部分原子都是直接穿過金箔的把？
同理，光子在經過玻璃時，絕大部分都是直接穿過而不發生相互作用的。所以通常來說，出射光子和入射光子是一樣的（也許有極少量的光子是跟原子發生互作用的，但是往往數量太少，以至於我們檢測不到）。
那麼，如果我們較勁，光子密度很大的時候呢？就像原子轟擊實驗那樣，那麼，恭喜你，你可以進入了非線性光學領域。
這個領域說起來就太複雜了，樓主讀讀相關的書籍吧。
不過我後來又仔細想了想，貌似也不是那麼簡單，光在進入介質時，有效波長會發生變化，傳播速率也會發生變化，這樣一看，應該說還是會收到物質中原子電磁場的影響，從而導致波長變化，但是我還是覺得，應該不用考慮吸收釋放問題，畢竟原子內的電子在電場下的運動是非線性的，有了吸收釋放很容易發生非線性效應。因此絕大部分出射的光子應該還是原來的光子。
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