合成生物學在哺乳動物中應用和發展的制約因素是什麼?

時間 2021-05-31 06:59:22

1樓:HaibaraAi

最大的核心問題就乙個,通量太低,來自幾個方面。

生長慢,每代的時間長,培養更貴。意味著同樣操作能產生的資料比低等生物少很多,迭代速度慢。

載體不方便,沒有成熟的質粒系統,基因組操作在CRISPR之前非常麻煩。在有CRISPR之後好了很多,但是受限於生長速度,每輪操作也要花大量時間。

細胞分化種類多,不同細胞或許有些獨特的地方。

其他還有些基礎科學不清楚的問題,但也是和通量低相關的。

調控手段多,包括表觀修飾,一般轉錄調控,轉錄後調控,很多東西不明確。核心的轉錄調控研究方法一直在進步,比如Chip-seq,ATAC-seq,還有謝曉亮最近在搞的3C map。還有些結論非常模糊,比如3D genome的作用,現在有很多矛盾的結論。

當然這裡面有些東西可以避免。

Nucleosome,包括區域性的TF濃度問題,這些給模組化帶來潛在困難。

因為對於基礎知識了解不夠,元件可能不合適。目前真核裡用得最多的還是幾個來自於原核的幾個DNA binding domain(比如TetR),但實際上這和真核的機制是不一樣的,真核TF趨向於弱binding,局域高濃度,啟用轉錄。原核的DBD普遍太強,用是能用,有沒有潛在問題就不清楚了。

Khalil (Mo) lab發展了一系列Zinc Finger系統,看起來效果不錯。訊號轉導系統也不一樣,細胞感受外界訊號, 刺激系統往往包含多個部分。

不過這裡面很多問題,在這七八年都有長足進步,所以也沒有什麼一定做不了的困難。

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