請問用於實時定量pcr與普通半定量pcr的引物設計有什麼不同和要求嗎?

時間 2021-05-11 18:25:55

1樓:曉啦雞

一般qpcr和半定量pcr的引物是同乙個。用引物先跑半定量確定一下基因的表達是上調還是下調,然後才能跑qpcr來確定基因的更準確的表達量

2樓:看你走哪去

RT—PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction)是將RNA的反轉錄(RT)和cDNA的聚合酶鏈式擴增(PCR)相結合的技術。首先經BIOG反轉錄酶的作用,從RNA合成cDNA,再以cDNA為模板,在DNA聚合酶作用下擴增合成目的片段。RT—PCR技術靈敏而且用途廣泛,可用於檢測細胞中基因表達水平、細胞中RNA病毒的含量和直接轉殖特定基因的cDNA序列。

作為模板的RNA可以是總RNA、mRNA或體外轉錄的RNA產物。無論使用何種RNA,關鍵是確保RNA中無RNA酶和基因組DNA的汙染。用於反轉錄的引物可視實驗的具體情況選擇隨機引物、Oligo dT及基因特異性引物中的一種。

對於短的不具有髮夾結構的真核細胞mRNA,3種都可。

3樓:人之僵死

1.實時定量pcr引物務必要保證擴增效率,就是說每次擴增都是與理論值偏差不多的2倍擴增。所以正式實驗之前最好做引物效率測試,即以已知濃度稀釋樣品,觀察定量值是否與理論值相同。

在這方面要考慮引物本身的GC含量,PCR擴增片段的GC含量。此外,還要考慮擴增位置在cDNA上是否離polyA尾太遠,造成結果不穩定。考慮RNA不同剪下方式等等~~考慮off target,當然一般的off target都是可以通過溶解曲線看出來的,設計之前別忘了blast一下~~

2.我想你說的半定量是最後定條帶亮度吧,那麼你是沒有辦法精確確定引物擴增效率的。

具體取捨要根據你的實驗目的來哦~~~

4樓:lcy19712018

當然不同了。real-time引物短,一般100-200 bp左右,太長很浪費;普通PCR一般要在400多,太短容易和dimer分不開。具體設計要求也有差別,一般real-time引物設計都是通過軟體進行的,普通引物要求比較低。

5樓:春秋X-ray

沒做過半定量,一般螢光定量PCR測轉錄,都是相對定量,絕對定量需要有已知濃度的標準品。做基因合成和測轉錄引物不一樣,定量半定量應該沒區別,區別在於你是不是有標準曲線

螢光定量PCR是用來幹什麼的?

你好小仙女 在PCR反應體系中加入螢光基團,利用螢光訊號積累實時監測整個PCR程序,最後通過標準曲線對未知模板進行定量分析。隨著PCR反應的進行,PCR反應產物不斷累計,螢光訊號強度也等比例增加。我們實驗室用BIOG PCR技術測得的擴增曲線起跳值一般在30左右,每經過乙個迴圈,收集乙個螢光強度訊號...

為什麼定量PCR的引物不可以使用RNA

PassionForLife PCR當然可以用RNA作為引物,事實上,我們自己的DNA複製很大程度上都是依靠RNA作為引物來實現的。回到你的問題,如果你的目的是為了定量,假設你的設想是完全正確,你的RNA引物切除酶每個擴增迴圈也只切你的RNA引物一次的話,這個也不能使定量更精確,你還是需要標準曲線來...

請問PCR跑出這種情況,應該怎麼解決

牛肉絲炒豬肉絲 你的問題都沒有描述清楚,怎麼幫你呢?你的實驗目的是什麼,是希望你要檢測的目的基因擴增出來還是擴增不出來 做基因表達抑制或者敲低的時候,Ct值是大比較好的 這個PCR裡面是擴增定量多少個基因 絕對定量還是相對定量 如果是擴增乙個基因的話,那理論上融曲應該是單峰,而你是雜,多個峰的說明擴...