如何看待 David Liu 在 Nature 發表無需 DNA 模板的基因編輯新工具,有怎樣的突破?

時間 2021-05-09 07:03:39

1樓:

Primer editor在293T裡能做出比較好的編輯效果,所以文章裡show的位點主要是293T。在小鼠胚胎裡做不出編輯效率,在很多人和鼠的細胞系裡效果也參差不齊,是乙個非常挑位點,挑細胞系的編輯工具。

只能說其他工具做不出來時,可以用primer editor試試,可能管用。

2樓:各得其所eagle

Prime editing 目前發展的方向,一是提高編輯效率,畢竟比Cas9產生插入和缺失的頻率還是較低的,因為最初生成的是雜合鏈,在細胞進行自動修復下,最大概率是50%。二是延長RT模版,目前最大是80bp,如果能增加到200-300,基本上等同於可以人工改寫序列了,因為更長的插入可以通過多次插入實現。

3樓:

昨天剛剛精讀完全文,文章的簡單內容可以看樓上BioArt公號的文章,基本上把幾點主要的突出點都寫出來了,我說幾點他沒有說到的。

BE系統可以實現C -> T 或者是G -> A的單鹼基編輯,同時不產生雙鏈斷裂,而最新的PE系統不但可以產生所有的單鹼基突變,而且還可以設計插入(insertion),缺失(deletion),從這個角度來說,PE比BE概念上進步大很多。

PE的編輯效率在editing window裡還是比BE還是要低PE的indel問題比BE嚴重的多

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