能說說測序儀的測序技術和原理是什麼嗎?

時間 2021-05-09 19:48:00

1樓:Yunlong JIA

請問關於訊號採集的話,是每合成乙個鹼基就採集一次訊號,是同時一下次全部採集flowcell上的訊號,還是每個tile這個掃瞄呢?

2樓:

沒錯,就是乙個洞。他的剖面圖是這樣的:

裡面就是乙個洞,簡單到爆。這個洞中間是有乙個向內突出的結構的,是洞最窄的地方,圖里也是可以看出來的。這個分子有乙個神奇的性質,就是會自動的鑽進磷脂雙分子膜

紅的就是磷脂分子,我不會畫大家發揮想象力= =

然後腦洞大開的某某科學家就開發了乙個體系

左右兩個小池子,裡面放上電解質溶液。兩個池子中間有乙個非常非常小的洞,洞上貼著細胞膜。把剛才做好的通道蛋白類似物丟進去,就會自己插在膜上,就像上圖所示,形成了乙個「兩個池子由乙個通道蛋白的洞連著」的結構。

把乙個DNA分子丟在一邊,加電壓,測電流。

然後DNA就鑽進去啦!雖然我不懂為啥,大概是因為DNA本身帶電,然後就做成了乙個微型的電泳吧= =。而且鑽進去的是單鏈的DNA,通道是裝不下雙鏈DNA的,DNA在進到洞裡之前解旋了。

精彩的部分來了:單鏈DNA鑽進了洞裡,各個核苷酸就會逐個通過洞裡最窄的那個口。窄口比鹼基大一點,就會留下一點空隙讓電解質中的離子通過空隙。

四種鹼基大小不同,留的空隙大小不同,電解質離子通過的速率就不同,上上圖中電流錶的示數就不同。於是乎,電流錶顯示的不同電流大小就對應著不同的鹼基通過了窄口!!!

然後就有了這麼一張圖,不同的電流大小意味著不同的鹼基。

用標準的,單一鹼基的序列跑幾遍,就知道了鹼基和電流的對應關係,測序就開始了!

一條DNA!丟進去跑一圈!序列就全都搞定了!

不要PCR,不要998,只要一條DNA!!

天才之作!天才之作!天才之作!

不過現在還是有一些問題的,比如說單分子操控的技術成本太高,比如DNA總是在測到一半的時候斷掉= =,但是不得不說這個想法真是,remarkable!

好像有點跑題?無所謂啦!

還有!如果誰找到了原文獻,懇請您發給我~~~非常感謝!

大概就是這樣,吐槽我畫畫不好的

我女朋友畫畫好啊嘿嘿嘿~~~~~~

3樓:吳鏑

和PCR有關係啊。單分子DNA產生的訊號(無論是螢光訊號還是電訊號)難以被當前技術精確的捕獲,所以需要預先對每條DNA進行擴增使其增加到一定數量(通常需要擴增幾萬到幾十萬倍),將這些訊號集中在一起進行測定,以達到較高的準確度。

以Ion Torrent測序平台為例,其通過檢測鹼基互補過程中釋放氫離子引起的pH值改變進行測序,而乙個DNA分子釋放的氫離子難以被檢測到,所以要提前用PCR將其擴增,這樣一次反應就可以釋放出幾萬到幾十萬個氫離子,這就可以被檢測到了。

4樓:Xi Yang

蟹妖。最日常的Sanger測序是基於類似PCR的反應的,反應體系裡加入一定比例的雙脫氧並帶螢光的ddNTP。反應使用單向引物,從同乙個位置起始,如果乙個分子在這一步加上的是ddNTP,那它就不會繼續延伸了。這樣產生的一系列不同長度的產物,都帶有停止反應那個位置的鹼基所對應的螢光標記。

然後產物拉個單鹼基分辨能力的電泳,每個位置的螢光顏色對應於它的鹼基型別。

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