1樓：
除了「作者沒想到這樣弄」或者「這樣弄作者寫不下去」之外，單純腦補合理性的話我覺得有一下幾點：
當時主角小隊有兩個任務：1.打敗Boss；2.
阻止暴走的銀鎮。這兩個任務優先順序其實不好說，從上帝視角來說，暴走的銀鎮的危害更大（按設定貌似會威脅整個世界？）——當然最壞情況是Boss拿到蟲箭把主角隊團滅。
當時的情況來說，銀鎮（沒有後面攻略的情況下）比Boss更加危險，而且在銀鎮的能力被解除以前，大家都不知道怎麼樣可以把身體換回來，也就是說，即使是Boss的身體，那也是布加拉提在銀鎮能力生效時行動的憑藉。那至少在能夠徹底解決銀鎮之前，大家不會想著要去傷害自己當時的身體。另一方面，Boss替身能力很強，主角小隊需要盡量保持戰鬥力，不然如果少乙個布加拉提，Boss可能直接跳反把主角團乙個個秒了。
然後就是題主說到的「破壞銀鎮光球的那一刻」，理論上這個時候如果能夠順便給Boss的身體造成傷害的話，的確會對後面有幫助，但是題主的假設要成立需要許多前提：
布加拉提的鋼連手指能夠支援同時維持足夠多的拉鍊——記得動畫裡面布加拉提一般也就同時用最多2~3個拉鍊，而破壞光球的時候好像就已經是2、3個一起用了，不知道此時布加拉提能否再維持足夠多的拉鍊在Boss身體上。
替身能力能夠在破壞光球後繼續使用——動畫裡面光球被徹底破壞的時候，Boss的替身都虛化摸不到箭了，因此可能在靈魂交換的時刻，替身能力沒法使用。這個情況下，即使布加拉提能夠額外在Boss身體上放置拉鍊，也不清楚能夠在破壞光球後觸發
此外，從順序上來說，為了保證能夠快速破壞光球（否則Boss就會拿到蟲箭），布加拉提需要「當時的身體」保持完好來確保自身的狀態，因此也不能先把自己弄慘再去破壞光球——火車上和釣魚小子一戰就可以看出，把自己的身體拉開的情況下雖然可以不死，但是替身也會變弱。
最後我們來大致覆盤一下當時的情況：
銀鎮暴走，大家換靈魂
所有人醒來，要花時間弄清楚狀況，同時在外面的布加拉提（Boss身體）試圖奪箭未果
大家一邊分析銀鎮的能力，一邊檢視Boss的狀況，攻擊布加拉提的身體（內有Boss第二人格）
小飛機突然慘死，大家開始警惕Boss（此時因為不知道如果換回身體，不能破壞Boss的身體）
到外面之後，大家一邊在試探銀鎮，一邊檢視狀態，得知銀鎮能力的真實作用
喬魯諾懷疑Boss在主角團某人體內，提議用自己的能力檢測，大家相互懷疑
布加拉提信任喬魯諾，喬魯諾邊用滴血法邊靠近布加拉提
Boss突然發動緋紅之王，特里休心急使用替身，被緋紅之王反控從而控制身體
Boss開始一邊遠離主角小隊一邊追銀鎮（此時主角小隊從戰鬥力上還算占有優勢，也不能換回身體，依然沒有破壞Boss身體的必要）
Boss追上銀鎮，察覺到銀鎮能力的秘密，把銀鎮弄慘試圖獲取箭
小隊其他人（主要是公尺斯達和遠端的喬魯諾）在瘋狂阻止Boss，此時Boss已經幾乎得到了蟲箭，同時布加拉提從Boss的行為領悟到了破壞銀鎮的方法，也意識到Boss沒有完全破壞銀鎮
布加拉提趕緊徹底消滅銀鎮，阻止Boss
最後2個階段是唯一「破壞Boss身體有價值」的時機——因為此時小隊處於劣勢（從獲取蟲箭的角度），並且布加拉提知道了消滅銀鎮從而換回身體的方法。但是此時時間特別緊迫，布加拉提可能來不及想也沒有能力實施題主的計畫。
2樓：撓頭的dialog
不方便行動，肢解自己導致小隊其他成員無法收到自己援助而死亡對布姐來說是絕對不允許的
而且當時他們的注意力全集中在銀鎮與蟲箭，沒去想這麼多
為什麼布加拉提死後喬魯諾可以短暫召回靈魂，阿帕基就不可以？
冰淤 大概看了前幾個作者的回答，感覺都說的不對。其實原因也很簡單。我想大家都看過最後的 滾石篇 吧？原本是布加拉提乙個人被穿胸而死，這個死亡就是指教堂裡的情景。也就是說如果布姐在這裡沒有被續命，JOJO這一季就在教堂這裡完結了，其他人不會死。而後來公尺斯達一頓操作，改變了布加拉提在教堂死亡的命運，所...
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可能是一種廣受認可的同人設定 布加拉提絕對是很好的他可以對別人的痛苦感同身受從大罵納蘭迦讓他去上學能看出來稍微有點老派偏向嚴苛的那種對小隊成員有領袖的作用但是大概不會展現出那種溫情款款的感覺 應該是他的很多行為很寬厚很觸動人心很包容他真的很好很好很好所以大家忽略了他是乙個老道的黑幫更加側重他的母愛 ...
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Hirogawa 我和我乙個好友有過一段對話，我曾經向他安利過jojo，但是他拒絕了，還是畫風問題，畢竟一般宅確實比較難以接受這個畫風。然後我告訴他，那個舔人的是男的。其實一開始我也以為布姐是女的，甚至兩人打起來了我還在想他到底是男是女，不過還好，第二話還沒打完我就得到答案了。不怪其他人，布加拉提真...