生信平時的工作都是什麼呢?真的是機械化的麼?

時間 2021-06-03 19:55:11

1樓:chen586

專門做生信的實驗室,應該會有寫好的指令碼,不過一般都是針對常規處理,如高通量資料的質控、比對等。如果專案不是很特殊,可以直接套用。有指令碼的好處,不只是讓你去跑;而是提供了乙個很好的學習平台,通過執行、閱讀或適當修改指令碼,在前人的基礎上進行有目的的學習。

做完了這部分分析,不只是完成了任務,也學會了別人怎麼寫指令碼、怎麼處理資料,也就可以完成生信的入門了。

到了後面,每個專案的分析都是個性的。都需要自己在分析、理解了需求和目的後,不斷嘗試探索,去獲得後續的結果,繪圖展示,並通過多種方法來驗證。這部分一般沒有現有的指令碼,需要自己程式設計整合。

另外生信也不只是指令碼,或者說指令碼只是一小部分。更多的跟生物科研一樣,都需要好的科研問題、科研思維方式。

指令碼是我們去實現科研目的操作的一部分,我們希望是把機械的這一部分自動化,交給計算機來做;我們去做個性化的。個人認為生信的工作不是機械化,是去機械化。

2樓:123456

不是回實驗室第一樣工作就是寫自己的ChIP-seq分析流程,哪有現成的給你用- -

生信也不光是跑指令碼啊,計算生物學和生信的邊界很模糊,演算法開發也是生信重要的一部分。能做資料探勘只能算會搬磚,提高挖掘的效率,或者可以挖出來新東西,才算是合格的生信攻城獅

既然你已經定導,我的建議是不要在生物實驗室做生信,那你只會被別人當工具。生物工作者和生信工作者的溝通有天然的問題,好比設計師的甲方一樣難搞,總有一些「無厘頭」的要求。在他們眼裡很有可能你就是個「會畫圖」或者「會跑資料」的,做不得專案的主導,一作更是遙遙無期....

3樓:

你們老師沒錯啊,11G也有計科碩士啊。

本來就是這樣,會用個工具就叫生信,那我隨便找個高中生培訓一下都能當指令碼狗。你連指令碼狗都不如,那我真是無話可說了。

只是指令碼狗就麻煩不要自稱生信了。

你要本科真的學了那些玩意,自己寫乙個blast是沒有問題的,乙個把O(NM)優化到log級別的演算法,自己實現一下,看看實現的路上有哪些坑,再對著書去看。

本來資訊學重複成本低,你學乙個工具,自己實現一輪就知道自己會不會了,又不像生物,學乙個技術還要做實驗才知道坑點在哪。

4樓:Xi Yang

說指令碼都是寫好的,你只要跑就行,三年下來除了那點大家都會的東西,什麼自己的也學不到

為什麼不去成為寫那些指令碼的人?

在實驗室裡,自己不努力去學,就知道用現成的,變成廢柴不能怪別人。

如果世上真的有鬼,它們平時是在做什麼呢?

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