二代測序的讀長為什麼是固定的?

時間 2021-06-03 14:40:09

1樓:立夏

因為二代測序的讀長能力是有限的。二代測序基本上都是基於DNA聚合酶的延伸將帶有螢光基團的dNTP加到模板上,通過乙個個的互補配對將序列依次讀取出來。Illumina和華大測序儀都是相同原理。

在延伸了一段時間後,聚合酶的活力就會大大降低,錯誤率也會越來越高。當錯誤率高到不可容忍的時候,就必須停止測序反應。因為一開始出來的測序儀僅僅只能單端測50bp,進行優化提公升後延長到100bp,150bp,還有單端250bp。

現在雙端也能測150bp,加起來等於是300bp。各家公司都在努力提公升測序讀長,進行各種試劑和測序條件的優化,但是目前來講,由於自身方法的侷限性(包括酶的失活,阻斷基團切割的效率等等都會導致測序質量隨著測序長度不可逆地降低)仍然難以突破。無論如何,二代肯定沒辦法到一代測序的長度,更不可能到三代的長度。

因為讀長有限,測序儀都會選乙個固定的長度,例如50,100,150等等,方便準備測序試劑盒所需要的試劑和測序程式設定,以及後面的分析。因此,我們看到的就都是固定長度了。

2樓:基因Share

測序儀可以控制讀取長度的,儀器會順著DNA乙個鹼基乙個鹼基的讀取,在機器開始測序前,可以設定讀取的迴圈數,例如100Cycle.那麼NGS測序儀就會讀取100個鹼基。

Illumina二代測序的比較完整的介紹,比如什麼是文庫,什麼是測序深度?

Tammy Illumina提供多種具有強大功能的文庫製備試劑盒,提供最快速 最簡單的文庫製備工作流程。可讓您就任何生物體的基因組 轉錄組或表觀基因組提出幾乎任何問題。Sanger測序,二代測序是illumina測序的不同方法。Sanger測序,二代測序使研究人員可以探尋幾乎所有涉及到任何生物的基因...

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僅僅長的好看能嫁給富二代嗎?

Helios 能不能嫁給富二代這件事,你要搞定的可不是富二代,而是他家裡那個創一代,如果僅僅只是個花瓶,可能只是被富二代玩完就扔而已。對富二代的家庭來說,乙個合格的結婚物件得面面俱到,富二代可能傻,可他家的創一代可不傻,如果娶了個花瓶,怕不是真的富不過三代哦 說也沒用 能。長得好看就像男人有錢,肯定...