如何檢測前病毒?

時間 2021-06-02 16:49:14

1樓:郭昊天

這個方法現在也在不斷發展改進,乙個例子:https://www.

ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27678343

另一類常用的是mismatch的方法。相關的試劑盒也很多,原理大同小異。有前病毒插入的DNA比正常DNA要多出一段序列,如果將DNA解鏈再重新配對,那麼一定會有一些不能完全配對的DNA鏈(來自前病毒)。

對這些鏈進行識別,就可以估計前病毒的總量。這個方法也是目前做基因編輯常用的測定編輯效率的方法。下圖為乙個例子的原理示意圖,突變的T7E1 assay檢測,同理可以應用在前病毒檢測上:

第三種可以使用測序的方法進行檢測,簡單粗暴剛正面(壕)。

但是臨床應用上,有檢出限的問題。

比如每採集一萬個細胞,平均只有乙個細胞被感染。假設PCR對一萬個細胞的檢出限在0.1%,那麼就有很大可能出現假陰性。

假設檢出限在0.1%,而<0.1%的感染率未來仍有90%的可能會發病,那麼就幾乎白檢測……

為何不能對鑽石公主號郵輪的全員檢測病毒,沒有這樣的技術手段迅速確定病毒攜帶者嗎?

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