1樓：一恆
python 本身可以作為script語言來使用；它的強大的數學庫numpy和scipy幾乎可以替代matlab完成複雜的資料處理；matplotlib 可以實現高質量的資料做圖；pymol 本身就是 python 寫成的，可以實現結構做圖。python的物件導向的特點可以自己定義需要的庫，方便以後呼叫。由於這些工具都整合在python中，移植性當然不成問題。
另外，python還提供了其他的很有用的庫，比wxpython可以用來做出乙個圖形介面；另外還有庫可以將程式嵌入到網頁當中，成為乙個網頁應用。這些都可以使計算化學更加方便和友好。
理論計算常用的就是高斯和MS，MS軟體的Dmol3模組中完成的。PyQuante (Python Quantum Chemistry) 就是乙個使用python寫成的量化計算軟體。儘管PyQuante使用一些C語言來加速某些模組，它的計算速度與常用的量化軟體還是差了一些。
但PyQuante的優勢在於容易閱讀和修改。及其適用於新手學習，上手快。
2樓：江夏
在python中，檔案其實就是物件。通過open()函式，開啟檔案，檔案的屬性包括讀檔案，寫檔案，關閉檔案等.
檔案開啟方法
open(name[,access_mode='r'[,buffering=-1]])
name:檔案路徑
access_mode：開啟方式,可選選項，預設以唯讀的方式開啟。
buffering：用於指示訪問檔案所採用的緩衝方式,可選選項，預設是使用系統預設緩衝機制。其中0表示不緩衝。
1表示只緩衝一行資料，任何大於1的值代表使用給定值作為緩衝區大小。不提供該引數或者給定負值代表使用系統預設緩衝機制。
access_mode幾種方式
'r'：唯讀方式開啟。檔案必須存在；不支援寫，當檔案寫入資料時會報錯。
'w'：只寫方式開啟。檔案不存在建立檔案；檔案存在則清空檔案內容，採用write可重新寫入資料。不支援讀，當讀檔案資料時會報錯。
'a'：追加方式開啟。檔案不存在建立檔案；檔案存在則保留檔案內容，採用write可在檔案末行追加寫入資料。不支援讀，當讀檔案資料時會報錯。
'r+'：讀寫方式開啟。檔案必須存在；保留檔案內容，支援寫，採用write可在檔案首行處寫入資料，並覆蓋相對應位置的原資料。
'w+'：讀寫方式開啟。檔案不存在建立檔案；檔案存在則清空檔案內容，採用write可重新寫入資料。支援讀。
'a+'：以追加方式及讀寫方式開啟。檔案不存在建立檔案；檔案存在則保留檔案內容，採用write可在檔案末行追加寫入資料。支援讀。
'rb','wb','ab','rb+','wb+','ab+':以二進位制方式開啟檔案，其他的和上面一樣。
說明：
1.支援讀，表示可以使用檔案屬性read，readline，readlines
2.支援寫，表示可以使用檔案屬性write，writelines
3.'w'方式的寫，是清空檔案所有內容，重新寫入資料。
4.'a'方式的寫，不清空檔案內容，在檔案末尾追加的寫入資料。
5.'r+'方式的寫，不清空檔案內容，在檔案首行處寫入資料，並覆蓋相對應位置的原資料。
所以我覺得你這裡可以通過open函式直接讀取檔案然後對其進行處理即可。沒做過opj檔案的處理，所以不知道具體能不能行，以上是個人的意見。
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