1樓:sept sim
最近正在做這個,用一組有ground truth的資料嘗試了3個軟體:
CNVnator GitHub FP很高,難以做下游過濾BIC-seq2 還在run...
CNVkit GitHub 比較成功,通過適當的引數選擇可以得出sensitivity和specificity都是100%得結果
2樓:盧巨集超
CNV-seq;
cn MOPs;
Delly;
HMZ;
OncoCNV;
CopywriterR
GATK
Gindel
Hydra
CNVkit
GenomeStrip
Lumpy
CNV-RF
BIC-seq2
3樓:王理中
不詳細講了,分享乙個小筆記,有點亂,看的明白就算緣分吧。
CNVnator Based Analysis其實還是要自己看文獻研究的,想偷懶,沒門!
CNVnator here
Genome STRiP here
XHMM here
ExomeCNV
ExomeCopy
ExomeDepth
CoNIFER
CONTRA: Copy Number Analysis for Targeted Resequencing
More: Awesome-BioinfomaticsSoftware
如何看待現如今漢服現如今發展趨勢
不得不說,從抖音開始的這兩年已經不敢在碰,甚至是不想在碰任何與漢服有關的東西。入坑6年,從初一懵懵懂懂對漢服復興懷抱著偉大願望並一直愛著漢服到現在,在到現在高三變得對漢服現狀失望,以前的自己真的沒想到會這樣。當初的自己作為漢服萌新我小心翼翼的接觸漢服,生怕在規矩上出些差錯,因為我始終覺得漢服是老祖宗...
如何評價現如今的IG戰隊?
全體成員 2018年IG戰隊,從人員上來說確實五個點都是突出的,小將勇猛,老將穩健,戰術清晰,在整個聯賽裡面現在到了霸主的地位。整體實力磨合很高,從開賽初誇起的IG完全體,也確實是完全體。欠缺世界級比賽經驗, 大車車 我就說一下吧。ig小場超越edg,但是大場連勝和s6的edg還差的很遠,當乙個戰隊...
如何看待現如今的醫患關係?
明明 我去的小診所。以前從沒有長過痘,因為前段時間考研壓力大臉上爆痘,身體也有各種症狀,在學校時候在學校附近小診所看的,乙個女醫生,看我舌頭,詢問我各種身體狀況,買了一周的中成藥,花了我七八十塊錢,然後這段時間回到家以為不會再長痘了,結果依然長又硬又大又疼的痘,而且慢慢會變成黑色的痘印,因為怕在臉上...