1樓:美格基因
目前推薦的細菌基因組測序方案是一代+二代+三代,其中一代是做菌種鑑定,確認菌株資訊無誤;二代是用illumina測序平台完成,提供高精確度的資料輔助三代資料校正和基因組組裝。
當然啦,如果想直接上三代,三代可選擇使用PacBio sequel平台或ONT Nanopore平台完成測序,得到長序列能高效完成基因組組裝工作。
Nanopore 測序案例展示
1、細菌完成圖案例
主角:Pseudonocardia 假諾卡氏菌屬
特點:基因組大小超過 7 Mb,GC含量超過 74 %
測序方案:一代+二代+三代(ONT Nanopore)
結果:成功組裝得到 0 gap的完成圖,並得到細菌內的3個完整質粒序列
細菌完成圖圖譜展示
2、真菌精細圖案例
主角:Trichoderma 木菌屬
特點:基因組大小超過 31 Mb,GC含量 51 %
測序方案:一代+二代+三代(ONT Nanopore)
結果:成功組裝得到9條contigs,N50超過5.8 Mb
3、Sequel II 和 Nanopore 隨意 pick
上述兩種三代測序平台您現在可以隨意pick啦!您可以根據實驗需要選擇合適的三代測序平台。雙重選擇,只為滿足您的所有需求!
單菌基因組測序流程圖:
單菌基因組生物資訊分析流程圖:
單菌基因組測序產品技術引數如下:
精準醫療和二代測序是什麼關係?
笑林衛 做乙個比喻,精準醫療好比精確制導,是概念,比如我們希望採取精確打擊,斬首 行動。灣灣島的蔡大小姐,就特別怕我兔對他們進行精確打擊。是針對個體差異作出適合這個個體的診療方案。目前,國內通過CFDA的伴隨診斷產品中,還沒有採用NGS這個方法學的商業化產品被批准,PCR法倒是又批准的。最近CFDA...
第二代基因測序技術是否已經達到了實際應用水平?
啊嗚 第二代基因測序技術在科研領域已經被廣泛的應用了,只不過,科研領域的應用與普通人的生活有一定距離,很難被大眾所了解。我是做生物領域相關工作的,所以會經常接觸到二代測序技術在科研領域的應用。說乙個例子。今年,中國農業大學植物病理學系利用深度測序的方法對中國北方甜菜樣品進行檢測,構建了葉部和根部的兩...
三代試管和一代二代比有什麼優勢?
最長的電影 第三代試管嬰兒發展以來,比第 一 二代的成功率高很多,在技術上,第一代試管嬰兒是針對女性不孕問題,第二代是針對男性不育問題,而第三代試管嬰兒技術可以通過PGS PGD篩查出更優質的胚胎進行移植,有效幫助試管嬰兒的成功。 小橙子媽媽 第三代試管嬰兒技術是在第 一 二代技術上發展而來,不僅在...