1樓：止戈
主要是由於dsRNA（RNA:DNA）形成的A型結構決定的。詳見:
Re: Why are RNA duplexes more stable than DNA duplexes in vitro?
2樓：黃家蔚
我能想到的兩個區別：
一是RNA不能形成超螺旋（2位的羥基有很強的hindrance）而DNA可以，當鏈長到一定程度的時候，解鏈是從一些薄弱的區域開始的（at，au多的地方），此時DNA由超螺旋儲存的拓撲自由能被用於開啟剩餘的氫鍵，所以會比RNA更容易完全解開。
二是RNA可以形成比較複雜的二級結構（這也是由那個多餘的羥基引起的），所以氫鍵更多，復性也更容易。這實際上是進化上乙個很深邃的問題——在我們當前的生物圈裡面，DNA更穩定，但是這種穩定幾乎完全依賴於雙鏈外側的化學惰性，比如說DNA在紫外線面前就不堪一擊，因而在歷史上的某個時期，RNA有可能更有優勢。由此還有另乙個有趣的結論：
DNA反覆凍融會比RNA更容易降解。
綜上，現實中，要想讓RNA表現得比DNA更難解鏈，一是序列要有足夠的長度，二是序列形成的二級結構，以及鹽濃度（影響氫鍵穩定性的關鍵因素）需要被考慮在內。
我沒有用過OligoAnalyzer，不知道它的演算法有沒有考慮以上兩個因素， @調和級數 瑣哥不妨找乙個tRNA的序列輸進去試一試。
忙且懶，就不列出參考文獻了，言不能悉意，謹候大方。
3樓：
先說一下雙鏈DNA ，有A=T，CG，互補配對，一般來說，CG配對越多，雙鏈越穩定，所需解旋溫度越高，參考PCR溫度，在80～100℃時，DNA雙螺旋開啟，形成兩條DNA單鏈，稱為變性。在50～60℃左右時，兩條DNA單鏈重新形成雙螺旋結構，稱為復性。
而另一方面，雙鏈RNA的結構更為複雜，有些資料顯示變性溫度為95℃左右，所以說二者是差異不大的，不能一概而論
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