Hiseq X10一直說本意是用於人重測序在醫療健康領域的應用,現在為何可用於非人高通量重測序了?

時間 2021-06-01 07:57:52

1樓:huizi1989519

Hiseqx10通量和時間是1.6-1.8T,3d。hiseq40001.3-1.5T;3.5d。

這兩款機器,FC是乙個革新點,都是奈米孔技術,112tile,以前是96個小方塊。這種晶元直接決定了通量更大,reads數更多。

另外,對比過兩台機器所用的試劑,Cbot試劑差別大一點,SBs試劑儘管名字上有點出入,個人感覺差不多,當然這個屬於illumina的機密啦。

機器方面曾經問過Illumina工程師,說其實4000就是單台x10,意思是,4000和x10在硬體和軟體方面確實比2000,2500更高階,但它們兩個可能就是雙胞胎。但是對於4000來說,一開始就是說可以上除了人重,還能上其他文庫等,但事實4000表現卻差強人意,很多不平衡或者特殊文庫連2000或2500的測序質量都趕不上。買了4000的買主,看上的一樣是高通量和時間節約成本這兩點,只不過不需要花更多的錢買x10,就目前4000的表現顯然不能滿足市場需求,樓主提到的其他型別的文庫,必然會外包一部分給有x10的公司,也就是說,x10和4000差不多,即x10其實各種測序型別也本來就是可以上的,且相容性更好,之所以一開始只推人重,個人感覺無非是illumina 要推3000,4000或其他測序儀,畢竟人家研發速度很快,但核心技術應該是一致的。

也許有人問,4000和x10差不多的,那為什麼表現沒有x10好,個人覺得,畢竟X10是10臺一起工作,相當於乙個集群,這種工作運轉模式應該是比乙個4000更有效率的,從通量和時間來看,也是X10更勝一籌,也不難理解了。

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